哮喘联盟

   目的：在哮喘儿童中研究总血清免疫球蛋白E（IgE）水平和8个候选基因的单核苷酸多态性（SNPs）（IL-4 rs2243250、IL-4Rα rs1805010、IL-13 rs20541、IL-13Rα1 rs2495636、CD14 rs2569190、TNF-α rs1800629、CTLA4 rs231775、FCER1B rs1441585）间的关系，并评价基因-基因间相互作用。
   方法：669名韩国哮喘患儿（544名过敏性哮喘患者和125名非过敏性哮喘患者）入选本研究。检测哮喘表现型和总血清IgE水平，并进行乙酰甲胆碱激发试验。采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性（PCR-RFLP）检测法对SNP进行基因分型。多因素将维（MDR）法用于分析基因-基因间相互作用。
   结果：通过对过敏性和非过敏性哮喘患儿的数据进行MDR分析，IL-13、IL-13Rα1和CTLA4三个基因的多态性作为一个整体入选（准确性= 0.5459；交叉验证的一致性[CVC] = 10/10）。IL-4Rα、IL-13、IL-13Rα1、CD14和CTLA4多态性作为过敏性和非过敏性哮喘患者总血清IgE水平增加的最佳模型（非过敏性哮喘：准确性= 0.4726, CVC = 10/10；过敏性哮喘：准确性=0.4573, CVC = 10/10）。IL-4Rα和IL-13的多态性与IgE水平相关。ANOVA分析显示，CTLA4和IL-13、IL-13和IL-13Rα1、IL-4Rα和IL-13、CD14和IL-13的多态性均与总血清IgE水平增加显著相关。
   结论：IgE水平增加的最佳模型中，包括IL-4Rα、IL-13、IL-13Rα1、CD14和CTLA4的多态性。这些多态性之间的诸多相互作用中，本研究显示CTLA4和IL-13的多态性及IL-13和IL-13Rα1的多态性对于血清总IgE水平增加具有协同作用。
                                                                       （陈欣 审校）
                                  J Asthma. 2012 Apr;49(3):243-52. Epub 2012 Feb 29.

Gene-Gene Interactions between Candidate Gene Polymorphisms Are Associated with Total IgE Levels in Korean Children with Asthma. 

Choi WA, Kang MJ, Kim YJ, Seo JH, Kim HY, Kwon JW, Yu J, Park SJ, Lee YC, Hong SJ.

Source
Asan Institute for Life Sciences , Seoul , Korea.

Abstract 
OBJECTIVE：To investigate associations between total serum immunoglobulin E (IgE) levels and single nucleotide polymorphisms (SNPs) from eight candidate genes (IL-4 rs2243250, IL-4Rα rs1805010, IL-13 rs20541, IL-13Rα1 rs2495636, CD14 rs2569190, tumor necrosis factor-alpha (TNF-α) rs1800629, cytotoxic T lymphocyte-associated antigen (CTLA4) rs231775, FCER1B rs1441585) in children with asthma and to evaluate gene-gene interactions.
METHODS：A total of 669 Korean children with asthma (n = 544 atopic n = 125 non-atopic) were included. Asthma phenotypes, total serum IgE levels, and methacholine challenge test results were evaluated. SNPs were genotyped using the polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphisms (PCR-RFLP) method. Multi-factor dimensionality reduction (MDR) was used to analyze gene-gene interactions. 
RESULTS：The combination of the IL-13, IL-13Rα1, and CTLA4 polymorphisms was selected through MDR analysis of the data pertaining to children with atopic and non-atopic asthma (accuracy = 0.5459, cross validation consistency (CVC) = 10/10). The IL-4Rα, IL-13, IL-13Rα1, CD14, and CTLA4 polymorphisms were selected as the best model of increased total serum IgE levels in non-atopic and atopic asthma (asthma: accuracy = 0.4726, CVC = 10/10; atopic asthma: accuracy = 0.4573, CVC = 10/10). Both the IL-4Rα and the IL-13 polymorphisms were correlated with the IgE level. ANOVA analysis revealed that the combinations of the CTLA4 and IL-13, IL-13 and IL-13Rα1, IL-4Rα and IL-13, and CD14 and IL-13 polymorphisms were all significantly associated with increased total serum IgE levels. 
CONCLUSIONS：The best model of increased IgE level included the IL-4Rα, IL-13, IL-13Rα1, CD14, and CTLA4 polymorphisms. Of the various interactions between these polymorphisms, the combinations of the CTLA4 and IL-13 polymorphisms and the IL-13 and IL-13Rα1 polymorphisms showed synergistic effects in terms of increased total serum IgE levels in the present cohort.

J Asthma. 2012 Apr;49(3):243-52. Epub 2012 Feb 29.