皮肤胶带剥离试验转录组揭示哮喘患儿表皮屏障功能和哮喘特征性改变
2024/07/31
背景:胶带剥离试验是评估一些皮肤病的微创方法,或可在过敏性哮喘患儿的皮肤中识别出哮喘特异性标志物。
方法:通过胶带剥离试验获取中度过敏性哮喘(n=11,平均年龄7.00;SD=1.67)、重度过敏性哮喘(n=9,平均年龄9.11;SD=2.37)与健康对照(n=12,平均年龄7.36;SD=2.03)受试的皮肤组织,进行RNA测序分析。将表达倍数≥2和FDR值<0.05定义为差异基因(DEGs)。进一步从哮喘相关结果(如急性加重频率、FEV1、R5-20和FeNO)、皮肤(屏障与免疫反应)和肺部(重塑、代谢和老化)致病途径等方面的指标来分析转录组学生物标志物在识别哮喘患儿与健康儿童的准确度。
结果:测序识别中度哮喘1113个DEGs和重度哮喘2117个DEGs。终末分化(FLG/丝聚合蛋白)、细胞黏附(CDH19, JAM2)、脂质生物合成/代谢 (ACOT2, LOXL2) 等表皮转录组学标志物显著下调。GSVA表明富集于Th1/IFNγ通路(p<0.01)。在中度及重度哮喘患儿组均发现G蛋白偶联受体(OR4A16/TAS1R3)表达升高、TGF-β/ErbB相关信号通路(ACVR1B, EGFR, ID1/2)和线粒体相关基因(HIGD2A, VDAC3, NDUFB9)表达降低。皮肤转录组标志物与年均急性加重频率和肺功能参数相关联。两种基因分类(TSSC4-FAM212B)可从普通人群中识别出哮喘患儿,准确率为100%。
结论:胶带剥离试验检测出哮喘患儿正常外观皮肤的上皮屏障与哮喘相关特征改变,可作为侵入性手段评估哮喘内型的替代方法。
关键词:气道重塑;过敏性哮喘;哮喘相关结局;过敏历程;上皮屏障;胶带剥离;转录组标志物。
文献来源:Del Duca E, Dahabreh D, Kim M, et al. Transcriptomic evaluation of skin tape-strips in children with allergic asthma uncovers epidermal barrier dysfunction and asthma-associated biomarkers abnormalities. Allergy. 2024;79(6):1516-1530. doi:10.1111/all.16060
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