改变的痰巨噬细胞转录组有助于中性粒细胞哮喘内型
2022/04/14
摘要
背景：中性粒细胞性哮喘(Neutrophilic asthma, NA)是临床上重要的哮喘表型，其细胞和分子基础尚不完全清楚。气道巨噬细胞是长期生存的免疫细胞，在哮喘失调中发挥重要的稳态和炎症功能。独特的转录组程序在体外反映了不同的巨噬细胞表型。我们的目的是确定在NA中是否有气道巨噬细胞的转录改变。
方法：我们对流式细胞术分离的痰巨噬细胞进行RNASeq分析，比较NA (n=7)和非中性粒细胞性哮喘(NNA, n=13)。对RNASeq结果进行qPCR验证(NA n=13, NNA n=23)。对差异表达基因(DEGs)进行通路分析(PANTHER, STRING)。采用基因组变异分析(GSVA)检测整个痰液微阵列中NA巨噬细胞转录组特征的富集(队列1 -对照组n=16, NA =29, NNA =37;队列2 U-BIOPRED对照，n=16, NA =47, NNA =57)。
结果：流式细胞仪分选了显著富集的痰液巨噬细胞（分选后99.4%，分选前44.9%，p<0.05）。RNASeq分析证实巨噬细胞纯度，并在NA巨噬细胞中鉴定出DEGs。经qPCR鉴定，共筛选出DEGs (SLAMF7、DYSF、GPR183、CSF3、PI3、CCR7，均p<0.05 NA vs NNA)。NA巨噬细胞DEGs的通路分析与细菌反应一致，有助于中性粒细胞招募，增加吞噬和排出细胞因子的表达。GSVA表明，在NA与NNA及各自对照组的整个痰液微阵列中，中性粒细胞巨噬细胞基因特征显著富集。
结论：我们证实了NA中痰巨噬细胞的转录组学程序与病理生理相关。在除中性粒细胞外的细胞类型中存在着炎症程序的转录激活，这一发现支持了NA作为一种特定表型的概念。
文献来源：An altered sputum macrophage transcriptome contributes to the neutrophilic asthma endotype. Fricker M, et al. Allergy 2021 Sep 12
背景：中性粒细胞性哮喘(Neutrophilic asthma, NA)是临床上重要的哮喘表型，其细胞和分子基础尚不完全清楚。气道巨噬细胞是长期生存的免疫细胞，在哮喘失调中发挥重要的稳态和炎症功能。独特的转录组程序在体外反映了不同的巨噬细胞表型。我们的目的是确定在NA中是否有气道巨噬细胞的转录改变。
方法：我们对流式细胞术分离的痰巨噬细胞进行RNASeq分析，比较NA (n=7)和非中性粒细胞性哮喘(NNA, n=13)。对RNASeq结果进行qPCR验证(NA n=13, NNA n=23)。对差异表达基因(DEGs)进行通路分析(PANTHER, STRING)。采用基因组变异分析(GSVA)检测整个痰液微阵列中NA巨噬细胞转录组特征的富集(队列1 -对照组n=16, NA =29, NNA =37;队列2 U-BIOPRED对照，n=16, NA =47, NNA =57)。
结果：流式细胞仪分选了显著富集的痰液巨噬细胞（分选后99.4%，分选前44.9%，p<0.05）。RNASeq分析证实巨噬细胞纯度，并在NA巨噬细胞中鉴定出DEGs。经qPCR鉴定，共筛选出DEGs (SLAMF7、DYSF、GPR183、CSF3、PI3、CCR7，均p<0.05 NA vs NNA)。NA巨噬细胞DEGs的通路分析与细菌反应一致，有助于中性粒细胞招募，增加吞噬和排出细胞因子的表达。GSVA表明，在NA与NNA及各自对照组的整个痰液微阵列中，中性粒细胞巨噬细胞基因特征显著富集。
结论：我们证实了NA中痰巨噬细胞的转录组学程序与病理生理相关。在除中性粒细胞外的细胞类型中存在着炎症程序的转录激活，这一发现支持了NA作为一种特定表型的概念。
文献来源：An altered sputum macrophage transcriptome contributes to the neutrophilic asthma endotype. Fricker M, et al. Allergy 2021 Sep 12
（中国医科大学附属第一医院呼吸与危重症医学科 李丹玲 苏新明）
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