一项混合作图荟萃分析提示18q21的遗传变异与拉丁裔哮喘易感性相关
2018/11/13
摘要
背景：哮喘是一种常见但复杂的疾病，在患病率、发病率和对治疗的反应方面存在种族/民族差异。
目标：对遗传祖先进行分析，以确定导致哮喘易感性的新基因座。
方法：我们利用了3,902名拉丁美洲人的混合血统，对哮喘易感性进行了荟萃分析。我们在一项3,774名拉丁美洲人的独立研究中复制了联系，对精细定位进行了靶向测序，并测试了来自3个种族/族群的> 500个人的全血中基因表达的疾病相关性。
结果：我们在拉丁美洲人的18q21处发现了全基因组显著的混合物图谱峰（p = 6.8x10-6），其中美国原住民血统与哮喘风险增加相关（OR = 1.20，95％CI = 1.07-1.34，p = 0.002），欧洲血统具有保护性（OR = 0.86,95％CI = 0.77-0.96，p = 0.008）。我们的研究结果在拉丁美洲人的独立儿童哮喘研究中得到了重复（p = 5.3x10-3，合并p = 2.6x10-7）。在1,978名拉丁美洲人中，18q21的精确定位确定了与墨西哥人中SMAD2的多个变体5'显著关联，而同一视图中的一个罕见变体是波多黎各人的顶级关联。低与高SMAD2血液表达与病例状态相关（13.4％低表达，OR = 3.93，95％CI 2.12-7.28，p <0.001）。此外，SMAD2的低表达与哮喘波多黎各人更加频繁的恶化相关。
结论：18q21的祖先与拉丁裔的哮喘显著相关，并且隐含SMAD2上游的多个祖先信息性非编码变体具有哮喘易感性。此外，血液中SMAD2表达下降与哮喘风险增加和恶化增加密切相关。
文献来源：An admixture mapping meta-analysis implicates genetic variation at 18q21 with asthma susceptibility in Latinos. Gignoux CR, Torgerson DG, et al. J Allergy Clin Immunol. 2018 Sep 7
背景：哮喘是一种常见但复杂的疾病，在患病率、发病率和对治疗的反应方面存在种族/民族差异。
目标：对遗传祖先进行分析，以确定导致哮喘易感性的新基因座。
方法：我们利用了3,902名拉丁美洲人的混合血统，对哮喘易感性进行了荟萃分析。我们在一项3,774名拉丁美洲人的独立研究中复制了联系，对精细定位进行了靶向测序，并测试了来自3个种族/族群的> 500个人的全血中基因表达的疾病相关性。
结果：我们在拉丁美洲人的18q21处发现了全基因组显著的混合物图谱峰（p = 6.8x10-6），其中美国原住民血统与哮喘风险增加相关（OR = 1.20，95％CI = 1.07-1.34，p = 0.002），欧洲血统具有保护性（OR = 0.86,95％CI = 0.77-0.96，p = 0.008）。我们的研究结果在拉丁美洲人的独立儿童哮喘研究中得到了重复（p = 5.3x10-3，合并p = 2.6x10-7）。在1,978名拉丁美洲人中，18q21的精确定位确定了与墨西哥人中SMAD2的多个变体5'显著关联，而同一视图中的一个罕见变体是波多黎各人的顶级关联。低与高SMAD2血液表达与病例状态相关（13.4％低表达，OR = 3.93，95％CI 2.12-7.28，p <0.001）。此外，SMAD2的低表达与哮喘波多黎各人更加频繁的恶化相关。
结论：18q21的祖先与拉丁裔的哮喘显著相关，并且隐含SMAD2上游的多个祖先信息性非编码变体具有哮喘易感性。此外，血液中SMAD2表达下降与哮喘风险增加和恶化增加密切相关。
文献来源：An admixture mapping meta-analysis implicates genetic variation at 18q21 with asthma susceptibility in Latinos. Gignoux CR, Torgerson DG, et al. J Allergy Clin Immunol. 2018 Sep 7
（中国医科大学附属第一医院呼吸与危重症医学科 苏新明）
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