哮喘中的鼻微生物群
2018/07/12
背景:鼻微生物可能影响哮喘病理生物学。
目的:我们试图描述哮喘患者、非恶化哮喘患者和健康对照者的鼻腔微生物学特征,以确定与哮喘活动相关的鼻微生物群。
方法:对72例成年哮喘患者(20例)、非加重型哮喘组(n=31)和健康对照组(n=21)获得的鼻拭子进行16S rRNA测序。使用QIIME、LEfSe、PICRISE和STEP进行分析。使用定量PCR验证发现与哮喘活动相关的物种。通过宏基因组功能预测也推断了与差异丰富的鼻类群相关的代谢途径。
结果:哮喘组、非恶化期哮喘组和健康对照组鼻腔细菌组成有显著差异(PrimoVa P= 2.2x10-2)。与对照组相比,哮喘患者的鼻腔菌群由拟杆菌群(Wilcoxon Mann-Whitney R=0.33,P= 5.1x10-3)和变形杆菌(R=0.29,p= 1.4x10-2)富集。在校正后的哮喘状态下,四个物种的差异丰富:多个比较:Prevotella buccalis,PADJ=1.0x10-2;Dialister invisus,PADJ=91x10-3;Gardnerella vaginalis,PADJ=2.8x10-3;Alkanindiges hongkongensis,PADJ=2.6x10-3。基于哮喘活动(哮喘恶化与非加重哮喘与对照)相比,这些种类和种类也有差异。QPCR证实了哮喘患者相对于Prevotella buccalis对照的物种过度表达(折叠变化=130,P= 2.1x10-4)和Gardnerella(折叠变化160,P=68X10-4)。Metagenomic推论显示基于哮喘活性的差异甘油脂代谢(Kruskal Wallis P= 1.9x10-4)。
结论:鼻微生物组分在哮喘加重、非恶化哮喘和健康对照组中有差异。所确定的鼻类群可以进一步研究哮喘的潜在机械作用和可能的哮喘活动的生物标志物。
参考文献:Mina Fazlollahi,et al. The Nasal Microbiome in Asthma. JACI, 2018 Mar 3
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