哮喘的全基因组关联研究

2011/08/11

   摘要
   支气管哮喘是由遗传和环境因素共同作用导致的常见的炎症性疾病。为了揭示哮喘相关的基因和细胞通路,对哮喘进行了大量的遗传学研究。全基因组关联研究(GWAS)旨在对多因素疾病和药物活性相关的基因进行综合评价,以增进对人类疾病的了解。从2007年开始,在白人、墨西哥人和非洲裔人群中进行了有关哮喘易感性的GWAS研究,而且找到数个易感位点。近期,通过合作的形式,进行了更大样本的GWAS分析,这样的分析具有更强的统计分析能力。通过对找到的基因的分析,显示上皮损伤与适应性免疫系统和气道炎症活化存在着相互作用。此外,GWAS也找到了一些候选位点,这些位点与肺功能的自然变异、血嗜酸细胞增多和嗜酸细胞性食管炎(为食管炎症,存在过敏反应,有嗜酸性细胞异常浸润)相关。比较哮喘的GWAS和其临床表现型可能有助于阐明哮喘的潜在发病机制。目前,正在进行利用GWAS药物基因组学对与激素吸入(ICS)和β2肾上腺受体激动剂吸入治疗有效性相关的遗传因素进行了分析。虽然还需要更全面的收集哮喘相关基因和通路,GWAS揭示的生物学规律为我们了解哮喘的病理生理学和开发更好的哮喘治疗和预防手段提供有价值的信息。 

                                                              (林江涛 审校) 
                              Allergol Int. 2011 Jun 25. [Epub ahead of print]


Genome-Wide Association Studies of Asthma.

Tamari M, Tomita K, Hirota T.

Source
Laboratory for Respiratory Diseases, Center for Genomic Medicine, The Institute of Physical and Chemical Research (RIKEN), Kanagawa, Japan.

Abstract 
Bronchial asthma is a common inflammatory disease caused by a combination of genetic and environmental factors. To discover the genes and cellular pathways underlying asthma, a large number of genetic studies have been conducted. Genome-wide association studies (GWAS), which comprehensively assess genes related to multifactorial diseases and drug reactivity, have enhanced understanding of human diseases. From 2007, GWAS of susceptibility to asthma in Caucasian, Mexican, and African-ancestry populations have been conducted and several susceptible loci were identified. Recently, much larger consortium-based GWAS analyses of collaborative samples with adequate statistical power were performed, and the implicated genes suggested a role for communication of epithelial damage to the adaptive immune system and activation of airway inflammation. Furthermore, GWAS identified candidate loci associated with natural variations in lung function, blood eosinophilia and eosinophilic esophagitis, which is inflammation of the esophagus with abnormal infiltration of eosinophils in an allergic reaction. Comparing GWAS in asthma and these clinical phenotypes might help to clarify the mechanisms underlying asthma. Pharmacogenomics analyses using GWAS regarding genetic factors related to the effectiveness of inhaled corticosteroid (ICS) therapy and inhaled beta(2)-adrenergic agonists are ongoing now. Although a more complete collection of associated genes and pathways is needed, biologic insights revealed by GWAS provide valuable insights into the pathophysiology of asthma and contribute to the development of better treatment and preventive strategies. 

Allergol Int. 2011 Jun 25. [Epub ahead of print] 


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