CEBPD调节气道平滑肌对糖皮质激素的转录组反应
2022/10/14
摘要
背景：CCAAT/增强子结合蛋白D (CEBPD)，一种多效性糖皮质激素反应转录因子，调节炎症反应。与哮喘相关的是，CEBPD在气道平滑肌(ASM)中的表达随着糖皮质激素暴露而增加。我们试图通过测量CEBPD敲除后观察到的变化及其对哮喘相关ASM功能的影响，来描述ASM中CEBPD介导的对糖皮质激素暴露的转录反应。
方法：用CEBPD或非靶向（NT）siRNA转染来自4个供体的原代ASM细胞，并暴露于载体对照、布地奈德（100 nM，18小时）、TNFα（10 ng/ml，18小时）或同时使用布地奈德和TNFα。随后，使用RNA-Seq测量基因表达水平，并获得暴露与载体和敲除与对照条件下的成对差异表达结果。进行加权基因共表达分析，以确定在不同实验条件下（即CEBPD敲除状态、暴露）中具有相似表达模式的基因组。
结果：在至少一次暴露条件下，CEBPD敲除改变了3037个基因的表达（q值< 0.05）。
共表达分析确定了分别与CEBPD敲除状态、TNFα暴露状态和两者相关的197、152和290组基因。JAK-STAT信号通路基因，包括IL6R和SOCS3，均受到TNFα和CEBPD基因敲除的影响。免疫印迹分析显示，ASM中CEBPD敲除减弱了布地奈德诱导的IL-6R蛋白表达和增强的IL-6诱导的STAT3磷酸化水平。
结论：CEBPD调节ASM的糖皮质激素反应，部分通过调节IL-6受体信号。
文献来源：Mengyuan Kan et al. CEBPD modulates the airway smooth muscle transcriptomic response to glucocorticoids. Respir Res. 2022 Jul 28. PMID: 35902923
背景：CCAAT/增强子结合蛋白D (CEBPD)，一种多效性糖皮质激素反应转录因子，调节炎症反应。与哮喘相关的是，CEBPD在气道平滑肌(ASM)中的表达随着糖皮质激素暴露而增加。我们试图通过测量CEBPD敲除后观察到的变化及其对哮喘相关ASM功能的影响，来描述ASM中CEBPD介导的对糖皮质激素暴露的转录反应。
方法：用CEBPD或非靶向（NT）siRNA转染来自4个供体的原代ASM细胞，并暴露于载体对照、布地奈德（100 nM，18小时）、TNFα（10 ng/ml，18小时）或同时使用布地奈德和TNFα。随后，使用RNA-Seq测量基因表达水平，并获得暴露与载体和敲除与对照条件下的成对差异表达结果。进行加权基因共表达分析，以确定在不同实验条件下（即CEBPD敲除状态、暴露）中具有相似表达模式的基因组。
结果：在至少一次暴露条件下，CEBPD敲除改变了3037个基因的表达（q值< 0.05）。
共表达分析确定了分别与CEBPD敲除状态、TNFα暴露状态和两者相关的197、152和290组基因。JAK-STAT信号通路基因，包括IL6R和SOCS3，均受到TNFα和CEBPD基因敲除的影响。免疫印迹分析显示，ASM中CEBPD敲除减弱了布地奈德诱导的IL-6R蛋白表达和增强的IL-6诱导的STAT3磷酸化水平。
结论：CEBPD调节ASM的糖皮质激素反应，部分通过调节IL-6受体信号。
文献来源：Mengyuan Kan et al. CEBPD modulates the airway smooth muscle transcriptomic response to glucocorticoids. Respir Res. 2022 Jul 28. PMID: 35902923
（中国医科大学附属第一医院 呼吸与危重症医学科 高与遥 孔灵菲）
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