肺功能、气道和外周嗜碱性粒细胞和嗜酸性粒细胞与重度哮喘类固醇反应的分子药物基因组学类型有关
2022/04/14
摘要
简介：哮喘是一种复杂的疾病，具有异质性的表达/严重程度。人们对哮喘类型的定义越来越感兴趣，认为这与不同的治疗反应有关，并认为2型炎症(Th2)是一类关键的病理机制。目前的哮喘类型主要是根据临床/实验室标准来定义的。每种类型都可能以明显的分子机制（能确定最佳治疗方法）为特征。
方法：我们对来自重症哮喘研究计划(Severe Asthma Research Program)的19名哮喘患者的痰液气道细胞RNA测序转录组数据进行了无监督(无预先临床标准)主成分分析，这些患者分别在基线和注射40mg肌内皮质类固醇后的6-8周受到随访。我们调查了主成分PC1和PC3与55个临床变量的关系。
结果：PC3与基线Th2临床特征相关，包括血液（秩和p=0.0082）和气道（秩和p=0.0024）、FEV1改变（Kendall tau-b R=−0.333（−0.592～−0.012））和随访FEV1沙丁胺醇反应（Kendall tau-b R=0.392 （0.079～0.634））。PC1和血嗜碱性粒细胞有关（秩和p=0.0191）。对PC1，PC3做出贡献的前5%基因在不同的免疫系统/炎症本体论中富集，这表明不同的受试者对皮质类固醇的转录组反应有不同的簇。PC3与FEV1变化的相关性在一个具有可比性的独立14名受试者(基线，每日吸入皮质类固醇(ICS) 8周后)气道上皮细胞microRNAome数据集中被复制。
结论：来自无监督方法的转录组学PCs定义了分子药物基因组学类型。针对哮喘皮质类固醇治疗受试者不同的特异性反应，这些基因组学类型可能产生新的生物学基础，以及最佳的个性化哮喘护理。这些PCs的主要贡献基因可能提示新的治疗靶点。
文献来源：Lung function, airway and peripheral basophils and eosinophils are associated with molecular pharmacogenomic endotypes of steroid response in severe asthma. Alvin T Kho, et al. Thorax. 2021. Sep 27.
简介：哮喘是一种复杂的疾病，具有异质性的表达/严重程度。人们对哮喘类型的定义越来越感兴趣，认为这与不同的治疗反应有关，并认为2型炎症(Th2)是一类关键的病理机制。目前的哮喘类型主要是根据临床/实验室标准来定义的。每种类型都可能以明显的分子机制（能确定最佳治疗方法）为特征。
方法：我们对来自重症哮喘研究计划(Severe Asthma Research Program)的19名哮喘患者的痰液气道细胞RNA测序转录组数据进行了无监督(无预先临床标准)主成分分析，这些患者分别在基线和注射40mg肌内皮质类固醇后的6-8周受到随访。我们调查了主成分PC1和PC3与55个临床变量的关系。
结果：PC3与基线Th2临床特征相关，包括血液（秩和p=0.0082）和气道（秩和p=0.0024）、FEV1改变（Kendall tau-b R=−0.333（−0.592～−0.012））和随访FEV1沙丁胺醇反应（Kendall tau-b R=0.392 （0.079～0.634））。PC1和血嗜碱性粒细胞有关（秩和p=0.0191）。对PC1，PC3做出贡献的前5%基因在不同的免疫系统/炎症本体论中富集，这表明不同的受试者对皮质类固醇的转录组反应有不同的簇。PC3与FEV1变化的相关性在一个具有可比性的独立14名受试者(基线，每日吸入皮质类固醇(ICS) 8周后)气道上皮细胞microRNAome数据集中被复制。
结论：来自无监督方法的转录组学PCs定义了分子药物基因组学类型。针对哮喘皮质类固醇治疗受试者不同的特异性反应，这些基因组学类型可能产生新的生物学基础，以及最佳的个性化哮喘护理。这些PCs的主要贡献基因可能提示新的治疗靶点。
文献来源：Lung function, airway and peripheral basophils and eosinophils are associated with molecular pharmacogenomic endotypes of steroid response in severe asthma. Alvin T Kho, et al. Thorax. 2021. Sep 27.
（中国医科大学附属第一医院呼吸与危重症医学科 李丹玲 苏新明）
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