鼻腔微生态及转录组学季节性变化与儿童哮喘急性加重有关
2022/02/28
摘要
背景：尽管呼吸道疾病的季节性变化和儿童哮喘的季节性发作已被证实，然而上呼吸道微生物是否在季节性变化中扮演的重要角色尚不清楚。
目的：假定鼻腔微生物群组成是季节性动态的，不同的微生物-宿主相互作用以特定的季节方式改变哮喘发作的风险。
方法：重复采集呼吸系统健康期间(基线期，n=181例)和首次发现呼吸系统疾病期间(n=97例)哮喘儿童的鼻拭子标本，进行细菌(16SrRNA基因)和真菌(ITS2)生物标志物测序。病毒检测采用多重多重聚合酶链反应（PCR）方法。配对鼻转录组数据进行季节动态和综合分析。
结果: 上呼吸道细菌和真菌微生物群及鼻病毒的检测呈现明显的季节性变化。在季节性调整的分析中，基线和呼吸道疾病微生物群的变化都与随后的发作有关。特别是在呼吸系统疾病和发作最频繁的秋季，几个卡他莫拉菌和嗜血杆菌属成员在病毒性呼吸道疾病和哮喘发作的患者标本中明显增多。由链球菌或葡萄球菌构成的两个不同的细菌网络与发作相关的SMAD3鼻上皮转录模块相互作用，显著增加恶化几率[OR=14.7,95%CI:1.50-144，p=0.02; OR=39.17,95% CI:2.44-626，p=0.008]。
结论：呼吸道疾病和哮喘发作患者上呼吸道微生物群随季节和季节变化而变化。季节性调整的分析显示特定的细菌-宿主相互作用显著增加这些儿童哮喘恶化的风险。
关键词：急性发作; 微生物组; 小儿哮喘; 呼吸系统疾病; 转录组学; 病毒感染。
文献来源：McCauley KE, Flynn K, DiMassa V, et al.; National Institute of Allergy and Infectious Diseases-sponsored Inner-City Asthma Consortium. Seasonal Airway Microbiome and Transcriptome Interactions Promote Childhood Asthma Exacerbations. J Allergy Clin Immunol. 2022 Feb 8:S0091-6749(22)00146-4.
背景：尽管呼吸道疾病的季节性变化和儿童哮喘的季节性发作已被证实，然而上呼吸道微生物是否在季节性变化中扮演的重要角色尚不清楚。
目的：假定鼻腔微生物群组成是季节性动态的，不同的微生物-宿主相互作用以特定的季节方式改变哮喘发作的风险。
方法：重复采集呼吸系统健康期间(基线期，n=181例)和首次发现呼吸系统疾病期间(n=97例)哮喘儿童的鼻拭子标本，进行细菌(16SrRNA基因)和真菌(ITS2)生物标志物测序。病毒检测采用多重多重聚合酶链反应（PCR）方法。配对鼻转录组数据进行季节动态和综合分析。
结果: 上呼吸道细菌和真菌微生物群及鼻病毒的检测呈现明显的季节性变化。在季节性调整的分析中，基线和呼吸道疾病微生物群的变化都与随后的发作有关。特别是在呼吸系统疾病和发作最频繁的秋季，几个卡他莫拉菌和嗜血杆菌属成员在病毒性呼吸道疾病和哮喘发作的患者标本中明显增多。由链球菌或葡萄球菌构成的两个不同的细菌网络与发作相关的SMAD3鼻上皮转录模块相互作用，显著增加恶化几率[OR=14.7,95%CI:1.50-144，p=0.02; OR=39.17,95% CI:2.44-626，p=0.008]。
结论：呼吸道疾病和哮喘发作患者上呼吸道微生物群随季节和季节变化而变化。季节性调整的分析显示特定的细菌-宿主相互作用显著增加这些儿童哮喘恶化的风险。
关键词：急性发作; 微生物组; 小儿哮喘; 呼吸系统疾病; 转录组学; 病毒感染。
文献来源：McCauley KE, Flynn K, DiMassa V, et al.; National Institute of Allergy and Infectious Diseases-sponsored Inner-City Asthma Consortium. Seasonal Airway Microbiome and Transcriptome Interactions Promote Childhood Asthma Exacerbations. J Allergy Clin Immunol. 2022 Feb 8:S0091-6749(22)00146-4.
（南方医科大学南方医院 黄俊文 赵文驱 赵海金）
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