哮喘相关竞争性内源RNA网络的构建揭示了新型长非编码RNA和潜在的新药
2020/03/27
摘要
背景：哮喘是一种以慢性气道炎症为特征的异质性疾病。长链非编码RNA可以作为与mRNA竞争的内源RNA，并在许多疾病中发挥重要作用。然而，关于哮喘中长链非编码RNA的结构和与长链非编码RNA相关的竞争性内源RNA网的概况知之甚少。在当前的研究中，我们旨在探讨哮喘患者中长链非编码RNA-microRNA-mRNA竞争性内源性RNA网络及其对治疗和预后的潜在影响。
方法：从“基因表达综合数据库”（Gene Expression Omnibus）数据库下载了与哮喘相关的基因表达谱，用这些基因重新注释，并鉴定出与哮喘相关的差异性表达的mRNA和长链非编码RNA。利用starBase数据库下载了长链非编码RNA-miRNA相互作用数据和mRNA-miRNA相互作用数据，以构建长链非编码RNA-miRNA-mRNA全面竞争内源性RNA网络，并提取与哮喘相关的差异性表达的竞争性内源RNA网络。最后，进行了与哮喘相关的差异表达竞争性内源RNA网络的功能富集分析和药物重新定位，以进一步明确与哮喘相关的关键的长链非编码RNA和潜在疗法。
结果：这项研究建立了与哮喘相关的竞争性内源RNA网络，确定了5个关键的长链非编码RNA（MALAT1，MIR17HG，CASC2，MAGI2-AS3，DAPK1-IT1），并确定了8种潜在的新药（他莫昔芬，鲁索替尼，维甲酸，槲皮素，达沙替尼，左卡尼汀，尼氟酸，格列本脲）。
结论：结果显示，长链非编码RNA在哮喘中起重要作用，且这些新的长链非编码RNA可能是潜在的治疗靶点和预后生物标志物。同时，通过药物重新定位技术发现了潜在的哮喘治疗新药，为哮喘的治疗提供了新的方向。
文献来源：Construction of asthma related competing endogenous RNA network revealed novel long non-coding RNAs and potential new drugs. Liao Y, et al. Respir Res. 2020 Jan 10;21(1):14.
背景：哮喘是一种以慢性气道炎症为特征的异质性疾病。长链非编码RNA可以作为与mRNA竞争的内源RNA，并在许多疾病中发挥重要作用。然而，关于哮喘中长链非编码RNA的结构和与长链非编码RNA相关的竞争性内源RNA网的概况知之甚少。在当前的研究中，我们旨在探讨哮喘患者中长链非编码RNA-microRNA-mRNA竞争性内源性RNA网络及其对治疗和预后的潜在影响。
方法：从“基因表达综合数据库”（Gene Expression Omnibus）数据库下载了与哮喘相关的基因表达谱，用这些基因重新注释，并鉴定出与哮喘相关的差异性表达的mRNA和长链非编码RNA。利用starBase数据库下载了长链非编码RNA-miRNA相互作用数据和mRNA-miRNA相互作用数据，以构建长链非编码RNA-miRNA-mRNA全面竞争内源性RNA网络，并提取与哮喘相关的差异性表达的竞争性内源RNA网络。最后，进行了与哮喘相关的差异表达竞争性内源RNA网络的功能富集分析和药物重新定位，以进一步明确与哮喘相关的关键的长链非编码RNA和潜在疗法。
结果：这项研究建立了与哮喘相关的竞争性内源RNA网络，确定了5个关键的长链非编码RNA（MALAT1，MIR17HG，CASC2，MAGI2-AS3，DAPK1-IT1），并确定了8种潜在的新药（他莫昔芬，鲁索替尼，维甲酸，槲皮素，达沙替尼，左卡尼汀，尼氟酸，格列本脲）。
结论：结果显示，长链非编码RNA在哮喘中起重要作用，且这些新的长链非编码RNA可能是潜在的治疗靶点和预后生物标志物。同时，通过药物重新定位技术发现了潜在的哮喘治疗新药，为哮喘的治疗提供了新的方向。
文献来源：Construction of asthma related competing endogenous RNA network revealed novel long non-coding RNAs and potential new drugs. Liao Y, et al. Respir Res. 2020 Jan 10;21(1):14.
(中国医科大学附属一院 苏新明）
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