成人哮喘和非哮喘者肺功能下降的全基因组关联研究

2012/05/08

   背景:全基因组关联研究已经寻找到了慢性阻塞性肺疾病、哮喘和肺功能水平的一些决定性因素,然而,尚未有肺功能下降的全基因组关联研究。
   目的:我们首次对哮喘状态分层后年龄相关FEV1下降及FEV1/FVC进行全基因组关联研究。
   方法:发现队列研究入选欧洲裔成人(1141名哮喘患者和2677名非哮喘者:哮喘遗传和环境流行病学研究、瑞士空气污染和成人肺、心脏病队列研究、欧洲社区呼吸健康调查)。评价FEV1及FEV1/FVC下降与250万个单核苷酸多态性的相关性。对30个位点采用硅片复制进行随访(1160名哮喘患者和10858名非哮喘参与者:社区动脉粥样硬化风险、弗雷明汉心脏研究、英国1958出生队列研究和荷兰哮喘研究)。
   结果:哮喘患者和非哮喘个体找到的主要信号存在差异。未见SNP达到基因组关联研究的显著性。非哮喘个体中,发现研究中显示的身高相关基因DLEU7与FEV1下降的相关性在后期硅片复制研究中得到重现(发现研究P= 4.8 × 10-6; 复制研究 P=0.03),敏感性分析显示FEV1与生长相关。哮喘患者中主要信号TUSC3与FEV1/FVC下降相关(P= 5.3 × 10-8),但在复制研究中未重现。过去显示的与横断面肺功能相关的SNP尚未发现与FEV1下降相关。
   结论:肺功能可能存在广泛的遗传异质性。我们结果显示,纵向和横断面肺功能遗传决定因素在不同哮喘状态个体中存在差异。
                                                                      (林江涛 审校)
                         J Allergy Clin Immunol. 2012 Mar 15. [Epub ahead of print]



Genome-wide association study of lung function decline in adults with and without asthma. 

Imboden M, Bouzigon E, Curjuric I, Ramasamy A, Kumar A, Hancock DB, Wilk JB, Vonk JM, Thun GA, Siroux V, Nadif R, Monier F, Gonzalez JR, Wjst M, Heinrich J, Loehr LR, Franceschini N, North KE, Altmüller J, Koppelman GH, Guerra S, Kronenberg F, Lathrop M, Moffatt MF, O’Connor GT, Strachan DP, Postma DS, London SJ, Schindler C, Kogevinas M, Kauffmann F, Jarvis DL, Demenais F, Probst-Hensch NM.

Source
Swiss Tropical and Public Health Institute, Basel, Switzerland; University of Basel, Basel, Switzerland.

Abstract 
BACKGROUND:
 Genome-wide association studies have identified determinants of chronic obstructive pulmonary disease, asthma, and lung function level; however, none have addressed decline in lung function. 
OBJECTIVE: We conducted the first genome-wide association study on the age-related decrease in FEV(1) and its ratio to forced vital capacity (FVC) stratified a priori by asthma status.
METHODS: Discovery cohorts included adults of European ancestry (1,441 asthmatic and 2,677 nonasthmatic participants: the Epidemiological Study on the Genetics and Environment of Asthma, the Swiss Cohort Study on Air Pollution and Lung and Heart Disease in Adults, and the European Community Respiratory Health Survey). The associations of FEV(1) and FEV(1)/FVC ratio decrease with 2.5 million single nucleotide polymorphisms (SNPs) were estimated. Thirty loci were followed up by in silico replication (1,160 asthmatic and 10,858 nonasthmatic participants: Atherosclerosis Risk in Communities, the Framingham Heart Study, the British 1958 Birth Cohort, and the Dutch Asthma Study).
RESULTS: Main signals identified differed between asthmatic and nonasthmatic participants. None of the SNPs reached genome-wide significance. The association between the height-related gene DLEU7 and FEV(1) decrease suggested for nonasthmatic participants in the discovery phase was replicated (discovery, P = 4.8 × 10(-6); replication, P = .03), and additional sensitivity analyses point to a relation to growth. The top ranking signal, TUSC3, which is associated with FEV(1)/FVC ratio decrease in asthmatic participants (P = 5.3 × 10(-8)), did not replicate. SNPs previously associated with cross-sectional lung function were not prominently associated with decline.
CONCLUSIONS: Genetic heterogeneity of lung function might be extensive. Our results suggest that genetic determinants of longitudinal and cross-sectional lung function differ and vary by asthma status.

J Allergy Clin Immunol. 2012 Mar 15. [Epub ahead of print] 


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