痰宏基因组学证实一类多重耐药铜绿假单胞菌优势型重度哮喘
2024/12/23
摘要
背景：既往研究主要通过靶向扩增子测序技术评估重度哮喘患者肺部微生物群结构，对其功能的评估仍较匮乏，且尚未有研究关注多民族亚洲人群
目的：采用宏基因组学方法，探究亚洲重度哮喘患者微生物表型的临床相关性。
方法：本研究是一项为期两年的前瞻性队列研究，纳入70名来自新加坡总医院和陈笃生医院的多民族亚洲重度哮喘患者，评估其临床、放射学和免疫学指标，并进行2年随访。采用宏基因组评估痰中微生物组、耐药性基因组和病毒基因组并分析临床结局相关性。
结果：亚洲多民族重度哮喘患者肺微生物组显示假单胞菌属物种丰度增加。痰宏基因组无监督聚类分析鉴定出两类患者群：C1（n = 52）集群以上呼吸道共生菌为特征；C2（n = 18）集群则由已知的呼吸道病原体主导，包括卡他莫拉菌、金黄色葡萄球菌和最显著的铜绿假单胞菌。C2集群在两年随访期间急性发作频率显著增加，且耐药菌群以多重耐药为主。病毒组在伴或不伴支气管扩张症的重度患者之间无显著差异。C2集群生物膜形成、基因表达传递系统和微生物运动性相关基因表达增加。将C2集群与非哮喘性支气管扩张队列进行独立比较，显示出类似的气道微生物毒力模式。
结论：痰液宏基因组学显示亚洲人群具有以铜绿假单胞菌为优势菌种的多重耐药性重度哮喘表型，该表型以较差的临床预后为特征，即便在未合并支气管扩张的情况下，急性发作频率亦显著增加。
关键词：铜绿假单胞菌；宏基因组学；微生物群；耐药基因组；重度哮喘。
文献来源：Ivan FX, Tiew PY, et, al. Chotirmall SH. Sputum metagenomics reveals a multidrug resistant Pseudomonas-dominant severe asthma phenotype in an Asian population. Respirology. 2024 Dec 2. doi: 10.1111/resp.14863. Epub ahead of print. PMID: 39622769.
背景：既往研究主要通过靶向扩增子测序技术评估重度哮喘患者肺部微生物群结构，对其功能的评估仍较匮乏，且尚未有研究关注多民族亚洲人群
目的：采用宏基因组学方法，探究亚洲重度哮喘患者微生物表型的临床相关性。
方法：本研究是一项为期两年的前瞻性队列研究，纳入70名来自新加坡总医院和陈笃生医院的多民族亚洲重度哮喘患者，评估其临床、放射学和免疫学指标，并进行2年随访。采用宏基因组评估痰中微生物组、耐药性基因组和病毒基因组并分析临床结局相关性。
结果：亚洲多民族重度哮喘患者肺微生物组显示假单胞菌属物种丰度增加。痰宏基因组无监督聚类分析鉴定出两类患者群：C1（n = 52）集群以上呼吸道共生菌为特征；C2（n = 18）集群则由已知的呼吸道病原体主导，包括卡他莫拉菌、金黄色葡萄球菌和最显著的铜绿假单胞菌。C2集群在两年随访期间急性发作频率显著增加，且耐药菌群以多重耐药为主。病毒组在伴或不伴支气管扩张症的重度患者之间无显著差异。C2集群生物膜形成、基因表达传递系统和微生物运动性相关基因表达增加。将C2集群与非哮喘性支气管扩张队列进行独立比较，显示出类似的气道微生物毒力模式。
结论：痰液宏基因组学显示亚洲人群具有以铜绿假单胞菌为优势菌种的多重耐药性重度哮喘表型，该表型以较差的临床预后为特征，即便在未合并支气管扩张的情况下，急性发作频率亦显著增加。
关键词：铜绿假单胞菌；宏基因组学；微生物群；耐药基因组；重度哮喘。
文献来源：Ivan FX, Tiew PY, et, al. Chotirmall SH. Sputum metagenomics reveals a multidrug resistant Pseudomonas-dominant severe asthma phenotype in an Asian population. Respirology. 2024 Dec 2. doi: 10.1111/resp.14863. Epub ahead of print. PMID: 39622769.
（南方医科大学南方医院 樊可可 陈颖 赵海金）
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