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CST1可能是哮喘合并过敏性鼻炎的生物标志物

2023/02/20

   摘要
   背景:变应性鼻炎(AR)是哮喘发病的重要危险因素。“一个气道”理论认为上呼吸道和下呼吸道是一个形态和功能的整体。然而,变应性疾病中一个气道生物标志物的研究尚少。
   目的:整合生物信息学技术探索气道变应性疾病的生物标记物,为预防AR患者发生哮喘提供分子机制。
   方法:通过WGCNA和差异基因分析鉴定AR和哮喘共同的关键基因,筛选生物标志物。使用DAVID进行GO和KEGG分析,并采用CIBERSORTx进行免疫浸润分析。根据ROC曲线确定了CST1对诊断Th2型哮喘的预测价值。利用GSEA分析CST1相关信号通路。TargetScan和miRNet与GSE142237结合构建ceRNA网络。利用CMap 探究潜在治疗药物。
   结果:分析表明,CST1是AR和哮喘患者上下呼吸道中唯一表达上调的基因,相关性热图显示CST1是相关系数总和最高的基因。GO和KEGG分析表明,与哮喘相似,AR患者下呼吸道主要发生炎症和免疫反应。免疫浸润分析显示CST主要与活化的CD4记忆T细胞呈正相关。根据ROC 曲线,CST1对Th2型哮喘有极佳的诊断效率。GSEA表明CST1参与了FcεRI信号通路和O-聚糖的合成。ceRNA网络由lncRNAs KCNQ1OT1和 NEAT1所构建。包括疣孢菌素A在内的四种药物有可能预防AR患者哮喘的发展。此外证明,糖皮质激素可下调 CST1的表达。
   结论:CST1在AR合并哮喘的发生发展中起关键作用,可能是气道变应性疾病的生物标志物。靶向CST1治疗或可预防AR患者哮喘的发展,值得深入研究。
   关键词:CST1;变应性鼻炎;哮喘;转录组学分析;统一气道

文献来源:Wang M, Gong L, Luo Y, et al. Transcriptomic analysis of asthma and allergic rhinitis reveals CST1 as a biomarker of unified airways. Front Immunol. 2023;14:1048195. Published 2023 Jan 17.
 

(南方医科大学南方医院 吴婕 赵雪莹 赵海金)

 


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